研究型大学是中国科研实力最强的大学、中国高等教育的脊梁。2013年度共有36所研究型大学。36所研究型大学占被评价的704所普通高校总数的5.11%，博士生导师数量占50.34%，教师数量占13.83%，培养的博士生占全国普通高校总数的59.62%，硕士生占30.45%，本科生占8.31%。
2013中国研究型大学遴选标准是：将全国所有大学的科研得分降序排列，前5%是研究型大学。
2013年，苏州大学首次进入研究型大学。
2013年度36所研究型大学名单（按科研得分排名）
| 排名 | 校名 | 得分 | 备注 | |
| 1 | 浙江大学 | 114.06 | 研究1型 | 国家重点建设大学 |
| 2 | 北京大学 | 110.76 | 研究1型 | 国家优先发展大学 |
| 3 | 清华大学 | 107.03 | 研究1型 | 国家优先发展大学 |
| 4 | 上海交通大学 | 85.88 | 研究1型 | 国家重点建设大学 |
| 5 | 复旦大学 | 82.93 | 研究1型 | 国家重点建设大学 |
| 6 | 南京大学 | 68.48 | 研究1型 | 国家重点建设大学 |
| 7 | 中山大学 | 58.46 | 研究1型 | 985工程大学 |
| 8 | 哈尔滨工业大学 | 57.37 | 研究2型 | 国家重点建设大学 |
| 9 | 武汉大学 | 56.74 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 10 | 四川大学 | 56.71 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 11 | 华中科技大学 | 55.26 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 12 | 山东大学 | 50.34 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 13 | 南开大学 | 48.25 | 研究1型 | 985工程大学 |
| 14 | 吉林大学 | 46.67 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 15 | 中国科学技术大学 | 42.04 | 研究1型 | 国家重点建设大学 |
| 16 | 西安交通大学 | 40.05 | 研究2型 | 国家重点建设大学 |
| 17 | 东南大学 | 37.59 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 18 | 中南大学 | 37.45 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 19 | 大连理工大学 | 35.95 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 20 | 天津大学 | 35.72 | 研究1型 | 985工程大学 |
| 21 | 中国人民大学 | 35.63 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 22 | 北京师范大学 | 34.18 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 23 | 华南理工大学 | 33.87 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 24 | 北京航空航天大学 | 31.88 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 25 | 厦门大学 | 31.62 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 26 | 同济大学 | 31.33 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 27 | 中国农业大学 | 27.42 | 研究1型 | 985工程大学 |
| 28 | 兰州大学 | 26.86 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 29 | 西北工业大学 | 25.81 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 30 | 重庆大学 | 25.07 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 31 | 北京理工大学 | 24.63 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 32 | 华东师范大学 | 23.63 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 33 | 华东理工大学 | 22.90 | 研究1型 | 211工程大学 |
| 34 | 湖南大学 | 22.44 | 研究2型 | 985工程大学 |
| 35 | 南京航空航天大学 | 20.64 | 研究2型 | 211工程大学 |
| 36 | 苏州大学 | 20.01 | 研究2型 | 211工程大学 |
武书连2013中国36所研究型大学综合实力纵览
| 科研排名 | 校名 | 自然科学 | 社会科学 | 理学 | 工学 | 农学 | 医学 | 哲学 | 经济学 | 法学 | 教育学 | 文学 | 历史学 | 管理学 | 艺术学 |
| 1 | 浙江大学 | A++ | A++ | A++ | A++ | A++ | A++ | B+ | A++ | A+ | A+ | A++ | B+ | A++ | A |
| 2 | 北京大学 | A++ | A++ | A++ | A+ | - | A++ | A++ | A++ | A++ | - | A++ | A++ | A++ | A+ |
| 3 | 清华大学 | A++ | A++ | A++ | A++ | - | A | B+ | A+ | A++ | - | A+ | A+ | A++ | A++ |
| 4 | 上海交通大学 | A++ | A+ | A++ | A++ | B+ | A++ | - | A+ | A+ | - | A+ | - | A++ | - |
| 5 | 复旦大学 | A++ | A++ | A++ | A+ | - | A++ | A+ | A++ | A++ | - | A++ | A++ | A++ | - |
| 6 | 南京大学 | A++ | A++ | A++ | A | - | A | A | A++ | A++ | A | A++ | A++ | A++ | A+ |
| 7 | 中山大学 | A++ | A++ | A++ | A | - | A++ | A | A++ | A++ | - | A++ | A | A++ | B |
| 8 | 哈尔滨工业大学 | A++ | A | A+ | A++ | - | - | - | B | B | - | B+ | - | A+ | B+ |
| 9 | 武汉大学 | A++ | A++ | A+ | A+ | - | A+ | A+ | A++ | A++ | - | A++ | A+ | A++ | A+ |
| 10 | 四川大学 | A++ | A++ | A++ | A+ | B+ | A+ | B | A | A+ | B | A++ | A+ | A+ | A |
| 11 | 华中科技大学 | A++ | A+ | A | A++ | - | A+ | B | A+ | A+ | - | A | - | A++ | B |
| 12 | 山东大学 | A++ | A++ | A+ | A+ | - | A+ | B+ | A+ | A+ | B+ | A++ | A | A+ | B+ |
| 13 | 南开大学 | A+ | A++ | A++ | A | - | B+ | A | A++ | A+ | - | A++ | A++ | A++ | B+ |
| 14 | 吉林大学 | A++ | A++ | A++ | A+ | B | A | B+ | A+ | A++ | B+ | A | A | A+ | B+ |
| 15 | 中国科学技术大学 | A++ | B+ | A++ | A+ | - | - | - | B | C+ | - | C+ | B+ | A+ | - |
| 16 | 西安交通大学 | A+ | A+ | A | A++ | - | A | C+ | A+ | A | B+ | B+ | - | A++ | - |
| 17 | 东南大学 | A+ | A+ | A | A++ | - | B+ | B | A | B+ | - | B+ | - | A+ | A++ |
| 18 | 中南大学 | A+ | A | A+ | A+ | - | A+ | - | B+ | A | B+ | A | - | A+ | B |
| 19 | 大连理工大学 | A+ | A | A+ | A++ | - | - | D+ | B | B | - | B | - | A+ | B |
| 20 | 天津大学 | A+ | A | A | A++ | C+ | B | - | B | B | - | B+ | - | A+ | B+ |
| 21 | 中国人民大学 | B | A++ | B+ | B | - | - | A++ | A++ | A++ | - | A++ | A+ | A++ | B+ |
| 22 | 北京师范大学 | A+ | A++ | A+ | B+ | - | - | B+ | A+ | A+ | A++ | A++ | A++ | A+ | A++ |
| 23 | 华南理工大学 | A+ | A | A | A++ | - | - | - | B+ | A | B+ | B+ | - | A+ | B |
| 24 | 北京航空航天大学 | A+ | A | A | A++ | - | - | - | B | B+ | B+ | B+ | - | A+ | C+ |
| 25 | 厦门大学 | A+ | A++ | A++ | A | - | B+ | B+ | A++ | A+ | - | A+ | A | A+ | A |
| 26 | 同济大学 | A+ | A | A+ | A++ | - | B+ | C | B+ | A | - | A | - | A+ | B+ |
| 27 | 中国农业大学 | A+ | A | A+ | A | A++ | - | - | B+ | B+ | - | C+ | - | A+ | - |
| 28 | 兰州大学 | A+ | A | A++ | A | B+ | B+ | D | A | B+ | B | A | A | B+ | C |
| 29 | 西北工业大学 | A+ | B+ | A | A++ | - | - | - | B | B+ | - | C+ | - | A | - |
| 30 | 重庆大学 | A+ | A+ | A | A+ | - | C+ | - | A+ | A | B+ | B+ | - | A++ | B+ |
| 31 | 北京理工大学 | A+ | B+ | A | A+ | - | - | - | B+ | B+ | B+ | B | - | A | - |
| 32 | 华东师范大学 | A | A+ | A+ | B+ | - | - | B+ | A | A+ | A++ | A+ | A+ | B+ | B+ |
| 33 | 华东理工大学 | A+ | B+ | A | A+ | - | B | - | B+ | B+ | - | B | - | B+ | - |
| 34 | 湖南大学 | A+ | A+ | A+ | A+ | - | - | - | A+ | A | B+ | B+ | B | A+ | A |
| 35 | 南京航空航天大学 | A+ | A | B+ | A+ | - | - | - | B+ | B | - | B+ | - | A+ | B+ |
| 36 | 苏州大学 | A | A | A+ | A | C+ | A | C+ | A | A+ | A+ | A | C+ | B+ | A |
2013中国大学各学科门等级类评价采用百分比法，用A、B、C、D、E共5等11级表示各大学的实力。各等级定义如下：
A等：前10%为A等；其中实力最强的前2%是A++级，介于2%～5%(含，以下同)之间的是A+级，5%~10%为A级。
B等：介于10%～30%之间为B等，占20%；其中 10%~20%为B+级，20%~30%为B级。
C等：介于30%～50%之间为C等，占20%；其中 30%~40%为C+级，40%~50%为C级。
D等：介于50%～70%之间为D等，占20%；其中50%~60%为D+级，60%~70%为D级。
E等：最后的30%为E等；其中70%～85%为E+级，85%~100%为E级。
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